Zielonka leży na styku Równiny Wołomińskiej i Kotliny Warszawskiej. Według studium uwarunkowań woda gruntowa zalega tu płytko — przeważnie 0,5–1,5 m pod powierzchnią, a w rejonie glinianek i w lasach na terenach bezodpływowych jeszcze wyżej. W podłożu leżą iły, piaski i torfy w zagłębieniach; glinianki to wypełnione wodą wyrobiska po wydobyciu iłów.
Na obszarze zabudowanym przeważają słabe gleby klas V i VI. W obniżeniach przy rzece Długiej są mady i gleby murszowe — dawne płytkie torfy po odwodnieniu przekształciły się w gleby murszowo-glejowe. Studium wskazuje też zagrożenie powodziowe wzdłuż Długiej, częściowo obwałowanej w mieście. Dlatego zanim zaproponujemy trawnik czy nasadzenia, sprawdzamy, jak głęboko jest woda na Twojej działce.