Według opracowania ekofizjograficznego z 2024 r. na wysoczyźnie przeważają gleby płowe i brunatnoziemne z glin i piasków gliniastych — na północy i południowym wschodzie gminy, gdzie leżą też najlepsze grunty orne (II klasa m.in. koło Dąbrówki, Zabłotni i Kłudzienka). Na północy po wydobyciu gliny zostały glinianki i stawy, np. w Natolinie, Chrzanowie i Kraśniczej Woli. Grunty klas V i VI skupiają się na południu, gdzie są też lasy koło Mościsk, Maryninu i Książenic.
Na płaskiej Równinie Błońskiej, zwłaszcza na północy, słabo przepuszczalne iły i gliny utrudniają wsiąkanie deszczu, więc woda gruntowa stoi wysoko; w gminie zmeliorowano ok. 3970 ha. Wiosną poziom wody przypowierzchniowej rośnie i na gruntach spoistych tworzą się rozlewiska; w ciągu roku waha się o ok. 1–2 m. W dolinie Rokitnicy na wschodzie gminy są obszary szczególnego zagrożenia powodzią. W praktyce w Grodzisku częściej trzeba zagospodarować nadmiar wody na działce niż walczyć z suchym piaskiem.